张镇芳是袁世凯的四个“顾命大臣”之一。哈汉章是黎元洪的军事“智囊”之一。他们两人是清朝末年军谘府的老同事。段祺瑞生平最看张不起，经常在背后骂他是“黄带子”“掌柜的”[1]，因此，张对段的恶感很深。袁死后，张向哈放了一把野火说：“我们在项城（袁）的灵前讨论总统问题时，老段反对黄陂（黎）继任，是东海（徐世昌）竭力促成的。”黎听进了这句话，对段更加怀恨，对徐则抱有好感。
黎之恨段并不是从这个时期开始的。以前他以副总统兼任湖北都督，地位实权兼而有之，后来段奉了袁的密令突然来到武汉，用绑票的手段把他押上火车，从此他就做了袁的政治俘虏。袁对他虽然棘手棘脚，还有虚伪的礼貌，段对他却只有一副冷酷可怕的面孔。袁死后，段到东厂胡同迎黎出任总统，并不是表示热情拥护，而是颐指气使，这对黎说来又是一个深刻而痛苦的烙印。在黎接任总统后的这些日子里，段总是把他当作盖印机器来使用的，甚至段的党徒也都只知有总理而不知有总统，黎对此更有“芒刺在背”之感。
段之看不起黎也有长期的历史根源。第一，前清时期，他自己做过统制（师长）、军统（军长）和提督，署理过湖广总督，而黎不过是一个协统（旅长）。第二，袁世凯当权时期，他是北洋派首屈一指的大将，而黎不过是一个无权无勇的政治俘虏。第三，目前黎的总统地位是他一手“提拔”起来的。因此，他认为对黎没有假以词色的必要。
>责任内阁制（责任内阁制是什么意思）
黎就总统后，调任教育总长张国淦为府秘书长。府秘书有林长民、贾寿坤、雷豫钊、欧阳葆真、刘远驹、张则川、瞿瀛、郭泰祺八人。军事幕僚有哈汉章、金永炎、蒋作宾、黎澍四人，军事幕僚经常建议总统必须掌握兵权。他们的理由是：“责任内阁制是指政治而言。军事方面，总统既然是全国陆海军大元帅，就不能不管。总统不管军事，就不如不做总统。”黎也觉得袁世凯做总统何等威风，我这个总统虽然不集权，毕竟还是一个总统，不能不管军事。这个意图与段的目的完全背道而驰：段以为他是以国务总理的地位掌握全国政权，以陆军总长的地位掌握全国军权的，总统不负实际责任，只能安分守己地做一个盖印机器。段的政治独裁是建筑在军事独裁的基础之上的，如果让总统管军事，就等于把自己放在手无寸铁的空位子上，这是他所不能忍受的。
陈宧
黎经常与孙中山、黄兴、岑春煊、唐绍仪等文电往来，段对此大为不满：“原来这些反对我的人都是你的好朋友！”此外，黎的军事幕僚擅自打电报劝陈宧通电取消独立，随后又劝陈宧自动解散军队，陈宧居然不向内阁请示而奉总统之命以行，因此段把这批幕僚恨入骨髓，指斥哈汉章、金永炎、黎澍、蒋作宾为“府中四凶”。黎管到与督军有关的问题，并且擅自解散北洋派的军队，段认为必须及时制止，决定采取杀鸡吓猴（杀陈宧）的手段以警戒黎。
黎接任总统后，对当前的重大问题由不问而要问，由要问而多问。他认为小事可以不问，大事必须过问。段本已苦于有一个国会使他对一切问题不能独断独行，现在再加上一个总统遇事掣他的肘，如何受得了。他有时向他的党徒发火说：“我是叫他来签字盖印的，不是叫他压在我的头上的！”
段自己不愿经常与黎见面，便把府秘书长张国淦当作府院之间的传声筒。一天，段请张转告，拟用徐树铮为国务院秘书长。这是张又一次碰到的同一个难题目：以前袁政府时期，段曾请他把用徐树铮为院秘书长的意见转达袁，他碰了袁的一次大钉子，他知道黎也是最恨徐树铮的。但是，他想到黎的性情比较“温厚”，或者不至于一口拒绝。不料他向黎提出时，这位“温厚”人物满脸都是气地说：“请你告诉总理，一万件事我都依从他，只有这一件办不到。”张不愿照实回答，便去找徐世昌研究一下。徐为此到公府来劝黎说：“我以为一万件事都可以不依从他，只有这一件必须办到”。他又补充说：“不要怕又铮（徐树铮）跋扈，芝泉（段）已经够跋扈的了，多一个跋扈的不见得更坏些”。
黎对徐不仅有好感，更重要的是徐与北洋派具有深厚关系，想利用徐以抵制段。黎提出一个交换条件：“以后院秘书长因公到府，必须与府秘书长偕同来见。”一九一六年六月十三日，发表了以徐树铮为院秘书长的命令。
徐树铮到职不久，就露出专断态度来。一天，因发表福建三个厅长的命令到公府办理盖印，黎偶然问到这三个人的出身和历史，徐树铮很不耐心地说：“总统不必多问，请快点盖印，我的事情很忙。”他出府后，黎向手下人气鼓鼓地说：“我本来不要做总统，而他们也就公然目无总统！”
张国淦
张国淦因在府院之间左右为难而辞职，八月一日继任府秘书长的就是前山东谘议局议员、现为参议院议员的丁世峄。丁认为府院职权极不明确，“国务会议事前既无议事日程，事后又无议事记录，总理不见总统，但凭院秘书长往返其间。发一令而总统不知其意，用一人而总统不知其来历。总统偶询一二语，院秘书长辄以现在实行内阁制，总统不必多开口为答。”因此，他提出“府院办事手续草案”，建议大总统得出席阁议，发表意见，但不得参加表决。大总统对国务得自由行使其职权。如用人不同意，得拒绝盖印。阁员应随时向总统面商要政。国务会议事前须将议事日程呈报，开会后须将议事记录呈阅。
事实上，不但院秘书长在总统的面前神气十足，就是院秘书长以下的院方人员，也从来不把总统当作一个应当尊敬的对象。有一个在国务院采访新闻的陈绍唐，经常称段为“相国”。这个名称是袁世凯用以称呼国务卿徐世昌的，现在帝制已经取消，国务卿的官制已经废止，再用洪宪时期的臭头衔加在段的头上，应当是一种侮辱，可是段却乐于接受这个称呼，陈绍唐因此取得国务院参议的名义，在徐树铮未就秘书长以前，经常被派到公府来，办理总统盖印手续。龙济光取消独立时，院方所拟嘉奖令有“该上将军具有世界之眼光”的一句话，黎看了大大摇头：“这句话实在安不上”。陈绍唐就很不礼貌地说：“总统如此挑剔，总理只有辞职不干！”又有一次，冯国璋保举海军第二舰队司令饶怀文为海军中将，经院方核准，陈绍唐送到公府来盖印。这天黎的肝火很旺，忍不住问了一句：“你是什么人，跑来跑去的，院秘书长哪里去了？”陈绍唐受了这场抢白，回到国务院无中生有地说：“总统认为院方不应核准这个保案，因为海军人员不能由陆军人员保举。”为了这件事，气得段请了好几天的病假。
由于府秘书长提出划分府院权限的方案，段的私党捏造府方行将恢复总统制的谣言，段又气得一连请假数日，到八月二十六日才销假视事。但他内心上未尝不想减轻府院之间的摩擦，因此向徐树铮下了一道手谕：“本院呈请大总统核阅文件，应责成该秘书长躬自递呈，用印后赍回。无论风雨黑夜，不得假手他人，以昭慎重而免差异。”又呈报黎说：“……逐日文件，均由徐树铮躬递。该员伉直自爱，不屑妄语，其于面对时，凡有声明为祺瑞之言者，祺瑞概负全责。”
关于府院权限问题，段坚持总统不应列席国务会议，最后双方成立协定如下：（一）关于国务会议，事前呈阅议事日程，事后呈阅议事记录；（二）会议后由国务员公推一人入府报告议决事项；（三）每逢星期五，国务员齐集总统府会商政务，举行聚餐；（四）总统对议决之案，如认为不合，得命总理及主管部阁员说明理由，如仍认为不合，得交复议一次；（五）未经国务会议议决之命令，总统得拒绝盖印。
